- Dipartimento per il sistema educativo di istruzione e formazione
Capo dipartimento: Dott.ssa Carmela PALUMBO
Direzione generale per gli ordinamenti scolastici e la valutazione del sistema nazionale di istruzione
Direttore generale: Dott.ssa Maria Assunta PALERMO
Direzione generale per il personale scolastico
Direttore Generale: posto vacante
Direzione generale per lo studente, l'integrazione e la partecipazione
Direttore generale: Dott.ssa Giovanna BODA
- Dipartimento per la formazione superiore e per la ricerca
Capo dipartimento: Provvedimento in corso
Direzione generale per la programmazione, il coordinamento e il finanziamento delle istituzioni della formazione superiore
Direttore Generale: Dott. Daniele LIVON
Direzione generale per lo studente, lo sviluppo e l'internazionalizzazione della formazione superiore
Direttore Generale: Dr.ssa Maria Letizia MELINA
Direzione generale per il coordinamento, la promozione e la valorizzazione della ricerca
Direttore Generale: Dott. Vincenzo DI FELICE
- Dipartimento per la programmazione e la gestione delle risorse umane, finanziarie e strumentali
Capo dipartimento: Dott.ssa Daniela BELTRAME
Direzione generale per le risorse umane e finanziarie
Direttore Generale: Dott. JACOPO GRECO
Direzione generale per i contratti, gli acquisti e per i sistemi informativi e la statistica
Direttore Generale: Dott.ssa Gianna BARBIERI
Direzione generale per interventi in materia di edilizia scolastica, per la gestione dei fondi strutturali per l'istruzione e per l'innovazione digitale
Direttore Generale: Dott.ssa Simona MONTESARCHIO